يعد البرنامج الطلاب للدراسة المتقدمة و البحث والصناعة في مجال هندسة الكمبيوتر. يبني برنامج ماجستير العلوم في هندسة الكمبيوتر أساسًا قويًا في جميع جوانب تصميم وتطوير أنظمة الكمبيوتر، مع التخصص في مجال رئيسي. يتابع الطلاب بحث الأطروحة تحت إشراف اعضاء هيئة التدريس يركز برنامج درجة الماجستير في العلوم في هندسة الكمبيوتر بشكل عام على تصميم وتنفيذ أنظمة الكمبيوتر.يتم التركيز على استكشاف طرق جديدة للتعامل مع أنظمة الكمبيوتر المعقدة والديناميكية. يمكن للطلاب استكشاف التفاعل بين الإنسان والحاسوب ،قواعد البيانات ،تصميم نظام VLSI ،أمن الشبكات،التصميم بمساعدة الكمبيوتر والأنظمة المدمجة والذكية . بالإضافة إلى أخذ دورات في لغات الكمبيوتر والبرمجة وهندسة البرمجيات المتقدمة. من أجل الحصول على درجة الماجستير في العلوم، يجب على الطلاب تحقيق 24 ساعة معتمدة من الدورات الدراسية بالإضافة إلى أطروحة تعادل 15 ساعة معتمدة (أي ما مجموعه 39 ساعة معتمدة). تتطلب الدورات الدراسية 4 دورات أساسية وأي دورات 4 من المجموعة الاختيارية.
قسم هندسة الحاسوب هو واحد من اقسام كلية الهندسة والتكنولوجيا في الأكاديمية العربية للعلوم والتكنولوجيا والنقل البحري. يقدم برنامجًا للدراسة لخريجيها الذين سيشاركون في الممارسة المهنية لهندسة الكمبيوتر من حيث صلتها بالتصميم والتطوير والبحث والمجالات الهندسية الأخرى والتدريس في الصناعة أو الحكومة أو الجامعة..
